南京医科大学紧跟时代前沿，积极应对国家在新时代人工智能平台建设方面的重大需求，在学科建设、科技创新、人才培养方面进行科学布局和探索，将智能医学研究理念，广泛应用在医学研究、虚拟手术、医学教育培训、康复训练等多个领域。
学校与东南大学进行深度合作，成立医工交叉创新研究院。双方通过科研资源共享、研究生共同培养和学术交流等方式，在精准医学、生物医用材料研发、数字化医疗、生物医学大数据、医疗机器人等研究领域展开全面合作。学校牵头启动国家重点研发计划相关项目，研制具有智能化自适应能力的康复训练设备，建立康复机器人训练的规范与流程，开创功能重塑新路径。
学校组建江苏省转化医学研究院，利用自身人才、科技资源优势，联合医院、高校、科研院所、企业等，开展人工智能医学方面的研发与应用，促进原创性研究成果的产出和科技成果的落地转化。目前已经启动两个批次的成果转化，涉及“医疗外骨骼机器人研发中心”、“虚拟护士”机器人、VR视力训练仪等多个项目，构建起实验室与临床之间的双向转化渠道，成为省内智能医学高效转化的管理与服务平台。学校还将智能技术应用于临床治疗。成立智能肿瘤会诊中心，患者可享受到全球大数据下对应病情最佳的诊断和治疗方案，为医疗精准化、服务便捷化、管理精细化带来重大变革。